
2023年9月26日,宁夏大学刘敦华教授团队在Food Chemistry(IF=8.8)上发表题为“TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration”的研究文章。研究人员利用TMT定量蛋白质组学共鉴定出377个差异表达蛋白(DEPs)。转铁蛋白、铁蛋白、谷胱甘肽过氧化物酶(GPX) 4和血红素加氧酶1等15种DEPs参与脂质过氧化、Fe2+ 和Fe3+ 转化、铁离子积累和线粒体氧化应激诱导铁死亡。此外,化学致癌物ROS、谷胱甘肽代谢、HIF-1和PPAR等信号通路可能通过影响游离铁过载和GPX4失活来促进铁凋亡。该研究成果中 拜谱生物体 为其提供 TMT球蛋白组学 的检测与分析,发现的差异蛋白有助于拓展屠宰后牛肉储存过程中铁死亡的生理和分子机制的认识。
PART 01
研究方案可是
探讨的人员探究性学习随着准确周期推移速冻准确周期拉长牛羊肉的对抗强度、持水利、成色、氧化钙份量态铁水分份量、ROS、脂质过被铁的氧化物、MDA、GSH和GPX4质量来考评腿部肌肉企业人体血细胞的铁意外死亡情况。结杲显现,速冻准确周期拉长后,牛羊肉的对抗强度在第四天和第6天偏态下滑;持水专业能力变低;色变深,失却质感,鲜黑色转化成暗黑色。除外,氧化钙份量态铁、抗逆性氧和MDA的水分份量偏态添加,人体血细胞凋亡率偏态提高。 学习工人取出有所差距冷冻的时间的相关肌肉组织样板的胆固醇质,如果对其进行SDS-PAGE浅析,胆固醇质条带在有所差距时占比不规则且相像(图1a)。基于胆固醇在有所差距样板中的展示实际情况,浅析发展统一个组样板的中十位数说出于统一个质量(图1b),阐明相关肌肉组织样板胆固醇质兼有不错的组内相像性和组间差距性。 血清质组学共鉴别出1996种血清质。以B0为對照组,需求B1、B2、B4和B6中的血清实施区别化描述方式方法研究,共鉴别到37七个DEPs。将火山图可视化效果,并只能根据FC > 1.2、FC < 0.86和P < 0.05几个标淮研究DEP。成果如图是1c-f右图,在B1/B0、B2/B0、B4/ B0和B6/B0中分发型别鉴别出22、33、73和140个DEPs,至少分发型别上涨6、11、32和83个,调低16、22、41和51个。聚类分析方式方法考评了不一冷藏库时候全身力量团体中血清质的描述方式方法,成果彰显全身力量血清描述方式方法区别化随着时光的推移贮存时光的新增而新增(图1g)。
图1| 有差异冷藏箱时刻的脂肪样本核膳食纤维组学(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图2| 不一样的冷冻箱周期的健身肌肉土样差异性核蛋白定量分析(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
表1 铁突然死亡蛋清肽的PRM化学发光法介绍(表源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图3| 立于KEGG生物富集异同形容球蛋白的铁阵亡考核机制(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 202
PART 02、拜谱个人心得体会
作者利用TMT定量蛋白质组学鉴定发现15个参与铁死亡调节的DEPs,包含铁离子运输、 Fe2+ 和 Fe3+转化、脂质氧化途径、氧化还原调节和含铁蛋白降解途径。铁死亡依赖于铁离子积累、GPX4失活和脂质过氧化。此外,通过对DEPs的蛋白质和途径相互作用分析,发现了37条代谢途径,通过调节细胞铁超载、细胞膜或细胞器膜脂质氧化和ROS积累来促进铁死亡。铁下垂机制的发现可能为提高牛肉冷藏品质的相关研究提供新的视角,可能有助于预测肉类的潜在质量和鉴定铁下垂的生物标志物。这一过程中拜谱动物提供了TMT一定量蛋清质组学技木服务性性,拜谱生物水平已產品研发搞定并建立联系了进一步优化旺盛期的转录组学、蛋清组学、产生组学或者多个学整合產品技木服务性性模式,欢迎致电咨询!
考生文献综述:Liu J, Liu D, Hu Z, Hu Y, Yu X. TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration. Food Chem. 2023 Sep 26. doi: 10.1016/j.foodchem.2023.137596.