
近日,南京市医科师范大学第一名付属三甲医院王学浩教授销售团队在Cancer Letters上发表了“O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma”的研究论文。该研究建立了一个涉及YBX1糖酵解和H3K18乳酸化的正反馈循环,从而加速了HCC的进展。破坏这种反馈循环可能为HCC提供一种新的治疗策略。拜谱生物为该研究提供了转录组测序,蛋清互作组和靶点精力产生检测分析服务。
日文标题文字:O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma(Cancer Letters IF:10.1)
中文名字小标题:YBX1的O-乙酰葡糖胺化修饰驱动肝细胞癌中糖酵解-组蛋白乳酸化反馈环路
客人企业单位:南京医科大学
研究分析原料:细胞
拜谱作为贴心服务:转录组测序+球蛋白互作组+靶点激光能量细胞代谢组
技艺自驾线路:
设计后果
01、YBX1被技术鉴定为HCC中糖酵解的要点人类基因
本学习采集器HCC癌症模本(n=7)的单进行RNA测序数值集去具体概述,遇到糖酵解灵活性通常集中授课在癌症进行中,hdWGCNA具体概述正常识别出9个基因组信息模块(图1A-G)。TCGA-LIHC链表的经营具体概述判断YBX1为自己经营安全风险原则(图1H)。进两步构建IHC、WB实践和癌症进行与相邻非癌症进行的环境空间转录组学数值集核实YBX1是肝进行癌疗法的风险靶点(图1I-K)。
图1:YBX1被选定为调低HCC体细胞糖酵解的重要的重要因素
02、YBX1促使HCC中的有氧糖酵解和分裂繁殖
为了研究YBX1在调控HCC糖酵解中的作用。构建YBX1敲低细胞系,靶点养分排泄组学检测,敲低后糖酵解途径的几个关键中间体显著减少,三羧酸(TCA)循环中间体的水平也降低了(图2A-D);结合葡萄糖碳示踪法、细胞外酸化率检测等实验证实YBX1敲低后,糖酵解活性受损,葡萄糖摄取和乳酸分泌减少,抑制HCC细胞增殖(图2E-K)。
图2:YBX1有利于HCC中的有氧糖酵解和繁殖
03、OGT与YBX1综合并增进YBX1的O-GlcNAc糖基化
为了识别YBX1的调控因子,蛋白质互作组分析显示YBX1与O-GlcNAc转移酶(OGT)相互作用,并结合Co-IP和共定位进行验证(图3A–E)。进一步创建了一个OGT K908A突变体,利用O-GlcNAc糖基化激活剂、抑制剂OSMI-1判断YBX1的O-GlcNAc糖基化的变化(图3F-H),结构域分析OGT的TPR结构域对于与YBX1的结合至关重要(图3I-L)。免疫沉淀YBX1的质谱分析揭示了六个潜在的O-GlcNAc糖基化位点,并结合点突变和分析证实T57是YBX1上关键的O-GlcNAc糖基化位点(图3M-O)。
图3:OGT与YBX1根据并催进YBX1的O-GlcNAc糖基化
04、YBX1的O-GlcNAc糖基化加强其磷硝化作用,得以增进其核转位
进一歩判断YBX1的O-GlcNAc糖基化能否反应其磷碱化,在OGT敲低的HCC神经元中或用OGT减弱剂OSMI-1整理,YBX1蛋清总体技术程度强势降低了,YBX1磷碱化强势减低(图4A-C)。IP调查界面显示,在类似的Flag-YBX1底物总体技术程度下,YBX1-WT的磷碱化总体技术程度强势高与YBX1-T57A,体现了磷碱化的多往往仅是所以更高些的YBX1蛋清展示(图4D)。分割了核和质类物质会会出现TMG整理的HCC神经元中YBX1核展示的增大(图4E-F),进一歩会会出现YBX1磷碱化的核心调节器系数是AKT(图4G-I)。那些会会出现更加注重O-GlcNAc糖基化顺利通过利于其磷碱化来减弱YBX1蛋清安稳性并利于核转位。
图 4.YBX1的 O-GlcNAc 淡化有帮助于其进的一步发生磷酸性反应淡化并能够加速其核转位
05、YBX1加快PKM2转录
前期结果表明YBX1 O-GlcNAc糖基化通过增强糖酵解和细胞增殖促进HCC进展。为了研究YBX1如何调控糖酵解,我们在HCC细胞中进行了转录组测序分析,糖酵解相关基因集在YBX1敲低细胞中显著抑制(图5A-B)。RNA 测序数据和 CUT&Tag 数据集以及ChIP-qPCR、QRT-PCR 分析表明PKM2 和 LDHA 是 YBX1 的直接转录靶标(图5C-H)。
图 5.YBX1促进会PKM2转录
06、YBX1 可以加强组淀粉酶乳酸性反应淡化能力
科学研究显示YBX1敲低相关性性拉低血清酶质乳硝化成用,十分是H3K18乳硝化成用(图6A-C)。糖酵解可抑制性剂2-DG的实践断定了糖酵解与组血清酶乳硝化成用的随便微信关联,可抑制性糖酵解可相关性性拉低H3K18la能力(图6D)。PKM2过展示可逆性转YBX1敲低伴发的H3K18la越来越低,之外源乳酸治疗仅仅优化H3K18la,还伴随着YBX1展示调整,提示卡的存在正方向跟进(图6E-G)。CUT&Tag与ChIP-PCR断定,H3K18la凭借含有于YBX1发动子随便有利于促进其转录,该过程中 受O-GlcNAc糖基化改善(图6H-J),并显示P300 调整是YBX1加强H3K18乳酰化成用的原则(图6K-L)。
图6.YBX1改善H3K18乳酸性反应突显标准
句子个人心得体会
在类似这些理论研究中报道范文了YBX1在HCC中高表述,还有就是与糖酵解迷切相应的的。YBX1在T57处被O-GlcNAc装饰,因而动态平衡核脂肪酸并减弱其表述。类似这些装饰还利于YBX1在T57处的磷过酸,利于其核易位。由于,这类历程减弱了糖酵解相应的的DNA的转录并促使乳酸的诞生。另外,YBX1激发P300的转录,继而能够组核球蛋白的乳过酸,越来越是H3K18la,H3K18乳过酸正向着调节作用YBX1DNA转录(图7)。
图7.Y糖酵解-表观遗传性双面馈环共识机制图
拜谱个人心得体会
本研究结合了单细胞转录组、空间转录组的数据,利用转录组、蛋白互作组、代谢组以及多种分子实验揭示了一个YBX1-糖酵解-H3K18la 的反馈回路,驱动HCC进展,并提示针对HCC代谢的潜在治疗策略。拜谱生物技术为该研究提供了转录组测序,蛋清互作组和靶向治疗精力分泌组技术服务,拜谱生态学建立了完善成熟的转录组学、核蛋白组学、泰语翻译后装饰组学、产生组学以及多组学联合产品技术服务体系,助力发表高分文献,欢迎致电咨询!
参阅论文资料
Ji Y, Xu Z, Tang L, Huang T, et,al.. O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma. Cancer Lett. 2025 Oct 28;631:217957. doi: 10.1016/j.canlet.2025.217957. Epub 2025 Jul 26. PMID: 40721081.